يعمل المركز الدولي للاستشارات والدراسات الاستراتيجية من خلال لجان متخصصة يشرف عليها اساتذة وعلماء متخصصين وهي :
- لجنة الاشراف على البحوث
- لجنة متابعة الدراسات المستقبلية .
- لجنة متابعة شؤون المرأة والطفل والشباب.
- لجنة السلم والتضامن العالمي .
- لجنة اقامة الدورات والندوات المتخصصة .
- لجنة العقود والاتفاقيات المشتركة .
- لجنة الطوارئ وتعمل في حالة تعرض الانسان اينما كان بحالات استثنائية كالحروب والكوارث الطبيعية .
- لجنة متابعة متضرري الحروب والكوارث .
- لجنة الاعلام والثقافة
ويشرف رئيس المركز على جميع هذه اللجان بشكل مباشر وتكون استقلالية كل لجنة اساس العمل المباشر وتقدم تقريرها وبحوثها بهذا الصدد.